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| 普通外科 |
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| 国家重点学科 |
| 南京军区南京总医院全军普通外科研究所 |
| 全军“重中之重”学科 |
| 全军器官移植重点实验室 |
| 江苏省重点学科(实验室) |
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| 神经外科 |
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| 全军神经外科中心 |
| 南京军区神经医学研究所外科部 |
| 江苏省“135”工程重点学科 |
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南京军区骨科专科中心 |
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南京军区心血管医学研究所外科部
江苏省“135”工程重点学科 |
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全军计划生育优生优育中心 |
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南京军区麻醉与复苏中心 |
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南京军区动物实验中心
江苏省动物实验供应基地 |
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| 肾脏病科 |
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| 南京军区南京总医院全军肾脏病研究所 |
| 全军“重中之重”学科 |
| 全军肾脏病重点实验室 |
| 江苏省重点学科(实验室) |
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南京军区心血管医学研究所内科部 |
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南京军区呼吸内科专科中心
江苏省“135”工程重点学科 |
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全军计划生育优生优育中心
南京军区儿科专科中心 |
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南京军区中西医结合中心 |
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